第1章 绪论 1.1 生物信息学的产生与发展 1.1.1生物学发展与计算机应用 1.1.2生物信息学及分支学科 1.1.3生物信息学发展阶段与研究方向 1.1.4我国生物信息学研究的发展方向 1.2 生物信息学基本方法与前沿技术 1.2.1基本方法 1.2.2前沿技术 1.3 生物信息学的应用 1.3.1生物信息的经济价值与生物信息学市场 1.3.2基因组分析 1.3.3基因芯片 1.3.4药物开发 1.3.5其他应用领域 1.4 生物信息学教育与学习 1.4.1生物信息学教育项目 1.4.2生物信息学的学习与实践 1.4.3本书要点 阅读材料 参考文献 第2章 生物信息学的计算机基础 2.1 数据管理与数据库技术 2.1.1数据管理的3种形式及其特点 2.1.2数据库基本概念 2.1.3数据库体系结构的3个抽象级别和两级数据独立性 2.1.4关系数据库 2.1.5数据库的保护 2.1.6数据库是高层应用的基础 2.2 计算机网络与Internet 2.2:1局域网与广域网 2.2.2客户机/服务器体系结构 2.2.3网络中的常用组件 2.2.4Internet及其发展 2.2.5TCP/IP协议 2.2.6IP地址和域名服务 2.2.7与Internet的连接方式 2.2.8Internet提供的服务 2.3 Internet上的高级信息管理 2.4 Java及移动计算 2.5 数据仓库和数据挖掘 2.6 其他的计算机知识 2.6.1算法和算法分析 2.6.2相似性度量 2.6.3配对算法 2.6.4分类与聚类 2.6.5隐马尔可夫模型 2.6.6人工神经网络 思考题 阅读材料 参考文献 第3章 生物信息学资源与数据挖掘工具 3.1 引言 3.2 生物信息学资源 3.2.1基因组信息 3.2.2蛋白质信息 3.2.3整合生物学信息 3.3 分子数据挖掘工具 3.3.1序列相似性查询软件 3.3.2通用序列查询和模式识别工具 3.3.3构建序列查询协议 3.3.4数据挖掘工具例子——GeneMine 思考题 阅读材料 参考文献 第4.. |
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