| 第1章 大规模基因组测序策略与技术 1.1 大规模基因组测序的常用技术 1.2 大规模测序的策略 1.3 逐步克隆法测序策略 1.4 全基因组霰弹法测序策略 1.5 大规模基因组测序的现状与发展趋势 第2章 生物信息数据库 2.1 文献检索 2.2 核酸序列数据库检索 2.3 基因组序列数据库检索 2.4 氨基酸序列数据库 2.5 蛋白质结构数据库PDB 2.6 疾病相关基因数据库 第3章 序列联配(BLAST、slM4) 3.1 Blast 3.2 Sim4 第4章 多序列联配(Clustal W) 4.1 C1ustal简介 4.2 目的 4.3 原理 4.4 步骤 4.5 结果及分析 第5章 测序分析软件(Phred／Phrap／Consed) 5.1 Phred碱基读取程序 5.2 Phrap序列组装程序 5.3 Consed图形化视图 第6章 EST序列分析系统 6.1 EST通道化分析系统(EST Analysis Pipeline System TM) 6.2 用户登录 6.3 主界面和界面说明 6.4 模块功能列表 第7章 蛋白质序列的功能注释、分类和代谢途径分析 7.1 蛋白质序列的功能注释 7.2 蛋白质序列的功能分类 7.3 蛋白质序列的代谢途径分析 7.4 蛋白质序列综合注释示例 第8章 ORF的搜寻及蛋白质结构预测 8.1 ORF的搜寻 8.2 蛋白质二级结构预测 8.3 用Swiss-model进行蛋白质三维结构预测 8.4 用PROSPECT进行蛋白质三维结构预测 第9章 华大基因研发中心网络资源 9.1 BTN简介 9.2 PASDB简介 9.3 RICE GD简介 9.4 UNIBLAST简介 9.5 HGP简介 9.6 TTEN简介 第10章 Bioperl 简介 |
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