| 序 原版前言 缩略语 a 生物信息学概述 a1生物信息学的范围 a2生物信息学与互联网 a3有用的生物信息学www网站 b 数据采集 b1dna、rna和蛋白质测序 b2蛋白质结构的确定 b3基因和蛋白质表达数据 b4蛋白质互作数据 c 数据库——内容、结构和注释 c1文件格式 c2已注释的序列数据库 c3基因组和特定物种的数据库 c4其他数据库 d 生物数据检索 d1通过entrez和 dbget/linkdb的数据检索 d2使用srs（序列检索系统）的数据检索 .e 通过序列相似性标准搜索序列数据库 e1序列相似性搜索 e2氨基酸替代矩阵 e3数据库搜索：fasta和 blast e4序列过滤程序 e5数据库的迭代搜索和psi-blast f 多序列联配：基因和蛋白质家族 f1多序列联配和家族关系 f2蛋白质家族和模式数据库 f3蛋白质结构域家族 g 系统发育学 g1系统发育学、遗传分类学和存在论 g2构建系统发育树 g3大分子序列进化 h 序列注释 h1基因组注释原理 h2注释工具和资源 i 结构信息学 i1蛋白质结构的概念模型 i2蛋白质三维结构与蛋白质功能的关系 i3蛋白质结构和功能的进化 i4获取、观察和分析结构数据 i5结构联配 i6 已知三维结构的蛋白质分类：cath与scop i7蛋白质结构预测简介 i8通过比较建模预测结构 i9二级结构预测 i10高级蛋白质结构预测与预测策略 j 微阵列数据分析 j1微阵列数据：分析方法 j2微阵列数据：工具和资源 j3序列采样和sage k 蛋白质组数据分析 k1双向凝胶电泳数据分析 k2蛋白质质谱数据分析 l 高阶模型 l1分子途径的建模与重建 l2蛋白质互作生物信息学 l3高阶模型 m 生物学中的化学信息学 m1分子表示的规范 m2化学信息学资源 n 制药业中的生物信息学 n1生物信息学和药物发现 n2药物信息学资源 o 生物信息学计算的基本原理 o1运行计算机软件 o2计算机操作系统 o3软件下载和安装 o4数据库管理 进一步阅读文献 术语表 |
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