| 前言 1 绪论 1.1 生物信息学的历史 1.2 生物信息学的应用 1.3 生物信息学与其他学科的关系 2 生物数据库介绍 2.1 序列数据库 2.2 基因组数据库 2.3 占构数据库 2.4 功能数据库 2.5 其他数据库资源 3 序列比对 3.1 概述 3.2 序列比对的得分系统 3.3 两条序列比对方法 3.4 多条序列比对方法 4 生物信息学常用概率统计学方法简介 4.1 概述 4.2 序列对位显著性检验 4.3 贝叶斯统计在序列对位中的应用 5 数据库搜索 5.1 数据库检索 5.2 数据库搜索相似序列 5.3 序列提交 6 分子系统发育分析 6.1 系统发育与系统发育树 6.2 距离法 6.3 最大简约法 6.4 极大似然法 7 基因组学与基因预测 7.1 引言 7.2 基因组测序技术及序列组装 7.3 功能基因组学 7.4 比较基因组学 8 蛋白质结构与功能预测 8.1 蛋白质结构简介 8.2 蛋白质三维结构分类及蛋白质家族 8.3 三维结构比对 8.4 蛋白质基本性质预测 8.5 蛋白质二级结构预测 8.6 蛋白质高级结构预测 8.7 蛋白质互作分析 8.8 药物发现与设计 9 转录组与蛋白质组分析 9.1 转录组与基因芯片简介 9.2 基因芯片数据采集与分析 9.3 蛋白质组简介 9.4 双向凝胶电泳数据分析 9.5 蛋白质质谱数据分析 10 Perl语言在生物信息学中的应用 10.1 Perl简介 10.2 数据结构和程序控制 10.3 编写生物信息学应用程序 10.4 BioPerl应用 |
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