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常用生物数据分析软件(1光盘)

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常用生物数据分析软件(1光盘)

最 低 价:¥48.80

定 价:¥65.00

作 者:王俊/丛丽娟/郑洪坤

出 版 社:科学出版社

出版时间:2008-05

I S B N:703020622

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编辑推荐

姓名:王俊
作者简介:
作品:《全国英语等级考试有声词汇第四级(音带+书)》《公共卫生:政府的角色与选择》《胸部疾病胸腔镜全真手术(1光盘)》《政府卫生支出有效机制的研究:系统模型与经验分析》《纵隔镜手术学(精装)》《检察改革与创新实践》《马鞍山六朝墓葬发掘与研究》《发现智慧 - - 珍藏本(第八辑)》《当代阅读经典=推理破奇案珍藏版》《中华散文百年精华》《当代阅读经典=小故事大道理珍藏版》《当代阅读经典=智慧背囊珍藏版》《哲理小品:中国卷》《当代阅读经典 - - 国外散文百年精华》《当代阅读经典 - - 散文精选·名家名篇》《当代阅读经典=精短散文珍藏版》《哲理小品:外国卷》《当代阅读经典=卷首语珍藏版》《实用婚丧喜庆大全》《新编万事不求人》 姓名:丛丽娟
作者简介:
作品:《常用生物数据分析软件(1光盘)》 姓名:郑洪坤
作者简介:
作品:《常用生物数据分析软件(1光盘)》

内容简介

本书较为系统全面地介绍了生物信息学分析各个方面的软件用法,结合光盘具体实例,方便使用。全书共分8章,内容包括:Unix/Linux操作系统介绍,介绍了基本的Unix/Linux操作命令;数据的基本处理,介绍了如何处理常用的生物信息学数据;序列的比对,介绍了常用比对软件的用法及其在应用过程中要注意的问题;基因组/基因的注释,介绍了Coding和Non-Codoing基因的预测方法;SNP分析,介绍了常用的从生物学数据中寻找SNP的软件;进化分析专题,介绍了几种分子进化分析软件,内容涉及进化树的构建、Ka/Ks的计算等;基因表达分析专题,介绍了EST及生物芯片分析的流程和方法;蛋白质结构预测,介绍了蛋白质三维结构预测的流程及方法。 本书适合于生物信息学专业本科生及研究生使用。

作者简介

目录


前言
第1章 unix/linux操作系统介绍
1.1 远程登录
1.2 文件的复制、删除和移动命令
1.3 目录的创建、删除及更改目录命令
1.4 文本查看命令
1.5 文本处理命令
1.6 改变文件或目录的权限命令
1.7 备份与压缩命令
1.8 磁盘及系统管理
1.9 软件安装简介
1.10 其他
第2章 数据的基本处理
2.1 数据常用格式介绍
2.2 测序原理介绍
2.3 華图转化(phred)
2.4 文件转换(phd2fasta)
2.5 载体屏蔽(cross_match)
2.6 序列聚类拼接
2.7 consed
2.8 引物设计(primer3)
主要参考文献
第3章 序列的比对
3.1 全局比对
3.2 局部比对
主要参考文献
第4章 基因组/基因的注释
4.1 重复序列分析
4.2 rna分析
4.3 基因预测
4.4 基因功能注释
主要参考文献
第5章 snp分析
5.1 polyphred
5.2 snpdetector
5.3 cross_match
主要参考文献
第6章 进化分析专题
6.1 phylip
6.2 paml
6.3 kaks_calculator
6.4 fgf
6.5 mega
主要参考文献
第7章 基因表达分析专题
7.1 est表达序列标签分析
7.2 生物芯片分析
7.3 motif预测
主要参考文献
第8章 蛋白质结构预测
8.1 蛋白质结构知识介绍
8.2 蛋白质结构预测方法
8.3 蛋白质结构预测的threading方法
8.4 蛋白质三维结构预测流程介绍
主要参考文献

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