| 序 原版前言 缩略语 A 生物信息学概述 A1生物信息学的范围 A2生物信息学与互联网 A3有用的生物信息学WWW网站 B 数据采集 B1DNA、RNA和蛋白质测序 B2蛋白质结构的确定 B3基因和蛋白质表达数据 B4蛋白质互作数据 C 数据库——内容、结构和注释 C1文件格式 C2已注释的序列数据库 C3基因组和特定物种的数据库 C4其他数据库 D 生物数据检索 D1通过Entrez和 DBGET/LINKDB的数据检索 D2使用SRS（序列检索系统）的数据检索 E 通过序列相似性标准搜索序列数据库 E1序列相似性搜索 E2氨基酸替代矩阵 E3数据库搜索：FASTA和 BLAST E4序列过滤程序 E5数据库的迭代搜索和PSI-BLAST F 多序列联配：基因和蛋白质家族 F1多序列联配和家族关系 F2蛋白质家族和模式数据库 F3蛋白质结构域家族 G 系统发育学 G1系统发育学、遗传分类学和存在论 G2构建系统发育树 G3大分子序列进化 H 序列注释 H1基因组注释原理 H2注释工具和资源 I 结构信息学 I1蛋白质结构的概念模型 I2蛋白质三维结构与蛋白质功能的关系 I3蛋白质结构和功能的进化 I4获取、观察和分析结构数据 I5结构联配 I6 已知三维结构的蛋白质分类：CATH与SCOP I7蛋白质结构预测简介 I8通过比较建模预测结构 I9二级结构预测 I10高级蛋白质结构预测与预测策略 J 微阵列数据分析 J1微阵列数据：分析方法 J2微阵列数据：工具和资源 J3序列采样和SAGE K 蛋白质组数据分析 K1双向凝胶电泳数据分析 K2蛋白质质谱数据分析 L 高阶模型 L1分子途径的建模与重建 L2蛋白质互作生物信息学 L3高阶模型 M 生物学中的化学信息学 M1分子表示的规范 M2化学信息学资源 N 制药业中的生物信息学 N1生物信息学和药物发现 N2药物信息学资源 O 生物信息学计算的基本原理 O1运行计算机软件 O2计算机操作系统 O3软件下载和安装 O4数据库管理 进一步阅读文献 术语表 |
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