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作 者:(美)CyntbiaGibas (美)PerJambeck/(美)CyntbiaGibas 著
出 版 社:科学出版社
出版时间:2002-05
I S B N:7030104218
| 第一部分 概述 第一章 计算机时代的生物学 计算是如何改变生物学的? 生物信息学难道仅仅是建立数据库吗? 信息学对生物学家意味着什么? 生物学给计算机科学家提出了哪些挑战? 生物信息学家应该有什么样的技巧? 为什么生物学家应使用计算机? 要进行生物信息学研究应该怎样设置PC机? 我们能找到什么信息和软件? 不上课我就能学会一门编程语言吗? 怎样利用Web信息? 怎样理解序列比对数据? 怎样编写一个程序来比对两个生物学序列? 怎样通过序列来预测蛋白质结构? 生物信息学能回答什么问题? 第二章 生物学问题的计算方法 分子生物学的中心法则 生物学家要建什么样的模型? 为什么生物学家要建立模型? 本书覆盖的计算方法 一个计算生物学的实验 第二部分 生物信息学工作站 第三章 建立工作站 在Unix操作系统下工作 建立一个Linux工作站 如何使软件运行起来 什么软件是必需的? 第四章 Unix中的文件和目录 文件系统基础 用于目录和文件的命令 在多用户环境中工作 第五章 在Unix系统下工作 Unix Shell 在Unix系统上发布命令 查看和编辑文件 转换和过滤器 文件统计和比较 正则表达式的语言 Unix Shell脚本 和其他计算机进行通信 在共享环境中和其他人轻松交流 第三部分 生物信息学工具 第六章 在Web上进行生物学研究 应用搜索引擎 查找科学文献 公共的生物学数据库 搜索生物学数据库 在公共的数据库中存储数据 查找软件 判断信息的质量 第七章 序列分析、成对比对以及数据库搜索 生物分子的化学成分 DNA和RNA的组成 Watson及Crick解决了DNA的结构问题 DNA测序方法的发展 genefinder和DNA特征的检测 DNA翻译 成对序列比较 在生物学数据库进行序列查询 序列分析的多功能工具 第八章 多序列比对、进化树和简图 从形态到分子 多序列比对 系统发育分析 简图和基序 第九章 蛋白质结构的可视化和结构性质的计算 关于蛋白质结构数据 蛋白质的化学性质 基于Web的蛋白质结构工具 结构可视化 结构分类 结构比对 结构分析 溶剂可接近性和相互作用 计算物理化学性质 结构优化 蛋白质资源数据库 把 |
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