| 本书共包括四个部分。第一部分介绍了计算机软件在核酸序列分析中的应用，主要包括序列格式转换、结构功能分析、克隆与引物设计等；第二部分介绍了计算机软件在蛋白质序列分析中的应用，主要包括理化性质分析、结构预测、三维分子显示等；第三部分介绍了计算机软件在序列比对中的应用，包括BLAST、本地BLAST、多序列两两比对与进化树分析等；第四部分介绍了计算机软件在文献管理与引用中的应用，主要包括文献管理、参考文献的引用等。 本书主要面向生物、医学专业的研究生、高年级本科生，以及相关专业的其他研究人员。 |
| 第一部分 核酸序列分析 1 序列检索与格式转换 1．1序列检索 1．2序列格式简介 1．3格式转换 2 一级结构分析 2．1组成成分分析 2．2重复序列 2．3序列变换 3 克隆 3．1酶切位点查找 3．2模拟电泳 3．3电泳图像分析 3．4质粒绘图 3．5克隆策略与过程显示 4 引物设计 4．1引物设计的基本原则 4．2引物设计与分析 4．3高通量引物与探针设计 5 测序拼装 5．1测序图分析 5．2测序拼装 6 DNA功能分析 6．1 ORF查找与翻译 6．2 Motif查找 7 RNA二级结构预测 7．1 RNAstructure 7．2 RNAdraw 7．3 DNAstar 第二部分 蛋白质序列分析 1 理化性质分析 1．1蛋白酶酶切特性 1．2滴定曲线与等电点 1．3亲水性和疏水性 1．4电荷密度 2 二级结构预测 2．1 DNAstar 2．2 Vector NTI Advance 2．3 ANTHEPR()T 3 其他特殊局部结构分析 3．1膜蛋白的跨膜螺旋 3．2信号肽 3．3卷曲螺旋 3．4抗原决定簇 4 三维分子显示 4．1 RasMol 4．2 Vector NTI Advance 4．3 Cn3D 第三部分 序列比对及进化树 1 BLAST 1．1 BLAST简介 1．2 BLAST、实践 1．3 BLAST、高级选项 2 本地BLAKI 3 多序列之间的两两比对与进化树分析 3．1 C1ustalX 3．2 DNAstar 3．3 Vector NTI Advance 3．4 PLYLIP 第四部分&nb |
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